Protein–RNA interactions for Protein: O88398

Avil, Advillin, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AvilO88398 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AvilO88398 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AvilO88398 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
AvilO88398 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
AvilO88398 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AvilO88398 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AvilO88398 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AvilO88398 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AvilO88398 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
AvilO88398 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AvilO88398 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AvilO88398 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AvilO88398 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AvilO88398 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AvilO88398 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AvilO88398 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AvilO88398 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AvilO88398 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AvilO88398 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AvilO88398 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AvilO88398 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
AvilO88398 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AvilO88398 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AvilO88398 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
AvilO88398 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AvilO88398 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AvilO88398 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17■□□□□ 0.31
AvilO88398 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AvilO88398 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AvilO88398 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
AvilO88398 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AvilO88398 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AvilO88398 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
AvilO88398 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AvilO88398 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AvilO88398 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AvilO88398 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AvilO88398 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
AvilO88398 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AvilO88398 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AvilO88398 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AvilO88398 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AvilO88398 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AvilO88398 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AvilO88398 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AvilO88398 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AvilO88398 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AvilO88398 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AvilO88398 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AvilO88398 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AvilO88398 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AvilO88398 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AvilO88398 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AvilO88398 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AvilO88398 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AvilO88398 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AvilO88398 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AvilO88398 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AvilO88398 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AvilO88398 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AvilO88398 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AvilO88398 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AvilO88398 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AvilO88398 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AvilO88398 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AvilO88398 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AvilO88398 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AvilO88398 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AvilO88398 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AvilO88398 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AvilO88398 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
AvilO88398 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AvilO88398 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AvilO88398 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AvilO88398 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AvilO88398 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AvilO88398 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AvilO88398 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AvilO88398 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AvilO88398 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AvilO88398 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AvilO88398 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AvilO88398 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
AvilO88398 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AvilO88398 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AvilO88398 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AvilO88398 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AvilO88398 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
AvilO88398 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AvilO88398 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AvilO88398 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AvilO88398 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AvilO88398 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AvilO88398 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AvilO88398 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AvilO88398 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AvilO88398 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AvilO88398 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AvilO88398 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AvilO88398 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms