Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnnal1O88327 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms