Protein–RNA interactions for Protein: O88174

Cd46, Membrane cofactor protein, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd46O88174 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd46O88174 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd46O88174 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd46O88174 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd46O88174 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd46O88174 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd46O88174 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd46O88174 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd46O88174 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd46O88174 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd46O88174 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd46O88174 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd46O88174 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd46O88174 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd46O88174 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd46O88174 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd46O88174 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd46O88174 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd46O88174 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd46O88174 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd46O88174 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd46O88174 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd46O88174 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd46O88174 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cd46O88174 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd46O88174 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd46O88174 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd46O88174 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd46O88174 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd46O88174 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd46O88174 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd46O88174 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd46O88174 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd46O88174 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd46O88174 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd46O88174 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd46O88174 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd46O88174 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd46O88174 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd46O88174 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd46O88174 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd46O88174 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cd46O88174 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd46O88174 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd46O88174 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd46O88174 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd46O88174 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd46O88174 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd46O88174 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd46O88174 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd46O88174 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd46O88174 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd46O88174 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd46O88174 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd46O88174 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd46O88174 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd46O88174 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd46O88174 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd46O88174 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd46O88174 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd46O88174 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd46O88174 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd46O88174 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd46O88174 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd46O88174 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd46O88174 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd46O88174 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cd46O88174 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd46O88174 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cd46O88174 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd46O88174 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cd46O88174 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd46O88174 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd46O88174 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd46O88174 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd46O88174 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd46O88174 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd46O88174 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd46O88174 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd46O88174 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd46O88174 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Cd46O88174 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd46O88174 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cd46O88174 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd46O88174 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd46O88174 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cd46O88174 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd46O88174 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd46O88174 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cd46O88174 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd46O88174 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd46O88174 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd46O88174 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd46O88174 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd46O88174 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cd46O88174 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd46O88174 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd46O88174 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd46O88174 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd46O88174 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms