Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vamp4O70480 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vamp4O70480 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms