Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms