Protein–RNA interactions for Protein: O70258

Sgce, Epsilon-sarcoglycan, mousemouse

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgceO70258 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SgceO70258 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SgceO70258 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SgceO70258 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SgceO70258 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SgceO70258 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SgceO70258 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SgceO70258 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SgceO70258 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SgceO70258 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SgceO70258 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SgceO70258 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SgceO70258 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgceO70258 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgceO70258 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgceO70258 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgceO70258 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgceO70258 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgceO70258 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgceO70258 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgceO70258 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgceO70258 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgceO70258 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgceO70258 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgceO70258 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgceO70258 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgceO70258 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgceO70258 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgceO70258 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgceO70258 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SgceO70258 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SgceO70258 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgceO70258 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgceO70258 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgceO70258 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgceO70258 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgceO70258 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgceO70258 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgceO70258 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgceO70258 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SgceO70258 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgceO70258 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgceO70258 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgceO70258 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgceO70258 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgceO70258 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgceO70258 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgceO70258 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgceO70258 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgceO70258 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SgceO70258 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SgceO70258 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgceO70258 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgceO70258 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgceO70258 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgceO70258 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgceO70258 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgceO70258 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgceO70258 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgceO70258 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgceO70258 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgceO70258 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgceO70258 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgceO70258 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgceO70258 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgceO70258 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgceO70258 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgceO70258 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgceO70258 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgceO70258 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SgceO70258 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgceO70258 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgceO70258 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgceO70258 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgceO70258 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgceO70258 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgceO70258 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgceO70258 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgceO70258 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgceO70258 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgceO70258 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgceO70258 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgceO70258 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgceO70258 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgceO70258 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgceO70258 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgceO70258 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgceO70258 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgceO70258 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SgceO70258 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgceO70258 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgceO70258 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgceO70258 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgceO70258 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgceO70258 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgceO70258 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgceO70258 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgceO70258 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgceO70258 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgceO70258 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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