Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChkbO55229 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChkbO55229 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ChkbO55229 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChkbO55229 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ChkbO55229 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ChkbO55229 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChkbO55229 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChkbO55229 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChkbO55229 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChkbO55229 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChkbO55229 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms