Protein–RNA interactions for Protein: O55144

Tlx3, T-cell leukemia homeobox protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx3O55144 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlx3O55144 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms