Protein–RNA interactions for Protein: O55128

Sap18, Histone deacetylase complex subunit SAP18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap18O55128 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sap18O55128 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sap18O55128 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sap18O55128 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sap18O55128 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sap18O55128 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sap18O55128 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms