Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Nipsnap2O55126 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap2O55126 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms