Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms