Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DffaO54786 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DffaO54786 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DffaO54786 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DffaO54786 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DffaO54786 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DffaO54786 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DffaO54786 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DffaO54786 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DffaO54786 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DffaO54786 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DffaO54786 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DffaO54786 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DffaO54786 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DffaO54786 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DffaO54786 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DffaO54786 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DffaO54786 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DffaO54786 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DffaO54786 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DffaO54786 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DffaO54786 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DffaO54786 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DffaO54786 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DffaO54786 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DffaO54786 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DffaO54786 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DffaO54786 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DffaO54786 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DffaO54786 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DffaO54786 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DffaO54786 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DffaO54786 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DffaO54786 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DffaO54786 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DffaO54786 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DffaO54786 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DffaO54786 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DffaO54786 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DffaO54786 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DffaO54786 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DffaO54786 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DffaO54786 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DffaO54786 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DffaO54786 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DffaO54786 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DffaO54786 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DffaO54786 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DffaO54786 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DffaO54786 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DffaO54786 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DffaO54786 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DffaO54786 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DffaO54786 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DffaO54786 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DffaO54786 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DffaO54786 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DffaO54786 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DffaO54786 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DffaO54786 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DffaO54786 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DffaO54786 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DffaO54786 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DffaO54786 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DffaO54786 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DffaO54786 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DffaO54786 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DffaO54786 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DffaO54786 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DffaO54786 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DffaO54786 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DffaO54786 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DffaO54786 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DffaO54786 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DffaO54786 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DffaO54786 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DffaO54786 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
DffaO54786 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DffaO54786 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DffaO54786 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DffaO54786 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DffaO54786 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DffaO54786 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DffaO54786 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DffaO54786 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DffaO54786 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DffaO54786 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DffaO54786 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DffaO54786 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DffaO54786 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
DffaO54786 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DffaO54786 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DffaO54786 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DffaO54786 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DffaO54786 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DffaO54786 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DffaO54786 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DffaO54786 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DffaO54786 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DffaO54786 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms