Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nek2O35942 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nek2O35942 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nek2O35942 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nek2O35942 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nek2O35942 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nek2O35942 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nek2O35942 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nek2O35942 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nek2O35942 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nek2O35942 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms