Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppfibp2O35711 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ppfibp2O35711 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms