Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Stag2O35638 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Stag2O35638 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Stag2O35638 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Stag2O35638 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Stag2O35638 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Stag2O35638 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Stag2O35638 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Stag2O35638 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Stag2O35638 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms