Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms