Protein–RNA interactions for Protein: O35367

Kera, Keratocan, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KeraO35367 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KeraO35367 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KeraO35367 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KeraO35367 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KeraO35367 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KeraO35367 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KeraO35367 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KeraO35367 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KeraO35367 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KeraO35367 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KeraO35367 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KeraO35367 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KeraO35367 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KeraO35367 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KeraO35367 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KeraO35367 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KeraO35367 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KeraO35367 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KeraO35367 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KeraO35367 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KeraO35367 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KeraO35367 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KeraO35367 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KeraO35367 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KeraO35367 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KeraO35367 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KeraO35367 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KeraO35367 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KeraO35367 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KeraO35367 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KeraO35367 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KeraO35367 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KeraO35367 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KeraO35367 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KeraO35367 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KeraO35367 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KeraO35367 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KeraO35367 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KeraO35367 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KeraO35367 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KeraO35367 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KeraO35367 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KeraO35367 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KeraO35367 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KeraO35367 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KeraO35367 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KeraO35367 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KeraO35367 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KeraO35367 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KeraO35367 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KeraO35367 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KeraO35367 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KeraO35367 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KeraO35367 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KeraO35367 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KeraO35367 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KeraO35367 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KeraO35367 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KeraO35367 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KeraO35367 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KeraO35367 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KeraO35367 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KeraO35367 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KeraO35367 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KeraO35367 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KeraO35367 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KeraO35367 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KeraO35367 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KeraO35367 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KeraO35367 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KeraO35367 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KeraO35367 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KeraO35367 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KeraO35367 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KeraO35367 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KeraO35367 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KeraO35367 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KeraO35367 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KeraO35367 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KeraO35367 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KeraO35367 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KeraO35367 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KeraO35367 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KeraO35367 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KeraO35367 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KeraO35367 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KeraO35367 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KeraO35367 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KeraO35367 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KeraO35367 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KeraO35367 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KeraO35367 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KeraO35367 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KeraO35367 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KeraO35367 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KeraO35367 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KeraO35367 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KeraO35367 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KeraO35367 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KeraO35367 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms