Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ColqO35348 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ColqO35348 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ColqO35348 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ColqO35348 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ColqO35348 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ColqO35348 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ColqO35348 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ColqO35348 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ColqO35348 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ColqO35348 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ColqO35348 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ColqO35348 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ColqO35348 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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ColqO35348 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ColqO35348 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ColqO35348 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ColqO35348 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ColqO35348 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ColqO35348 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ColqO35348 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ColqO35348 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ColqO35348 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ColqO35348 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ColqO35348 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ColqO35348 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ColqO35348 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ColqO35348 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ColqO35348 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ColqO35348 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ColqO35348 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ColqO35348 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ColqO35348 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ColqO35348 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ColqO35348 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ColqO35348 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ColqO35348 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ColqO35348 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ColqO35348 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ColqO35348 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ColqO35348 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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ColqO35348 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ColqO35348 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ColqO35348 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ColqO35348 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ColqO35348 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ColqO35348 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ColqO35348 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ColqO35348 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ColqO35348 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ColqO35348 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ColqO35348 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ColqO35348 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ColqO35348 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ColqO35348 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ColqO35348 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ColqO35348 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ColqO35348 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ColqO35348 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ColqO35348 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ColqO35348 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ColqO35348 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ColqO35348 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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ColqO35348 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ColqO35348 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ColqO35348 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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ColqO35348 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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ColqO35348 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ColqO35348 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ColqO35348 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ColqO35348 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ColqO35348 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ColqO35348 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ColqO35348 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ColqO35348 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ColqO35348 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ColqO35348 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ColqO35348 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ColqO35348 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ColqO35348 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ColqO35348 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ColqO35348 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ColqO35348 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ColqO35348 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ColqO35348 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ColqO35348 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ColqO35348 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ColqO35348 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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ColqO35348 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms