Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dgcr6O35347 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Dgcr6O35347 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dgcr6O35347 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dgcr6O35347 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dgcr6O35347 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dgcr6O35347 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dgcr6O35347 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dgcr6O35347 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Dgcr6O35347 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dgcr6O35347 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dgcr6O35347 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dgcr6O35347 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dgcr6O35347 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dgcr6O35347 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dgcr6O35347 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dgcr6O35347 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dgcr6O35347 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dgcr6O35347 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dgcr6O35347 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dgcr6O35347 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dgcr6O35347 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dgcr6O35347 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dgcr6O35347 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dgcr6O35347 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dgcr6O35347 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dgcr6O35347 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dgcr6O35347 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dgcr6O35347 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dgcr6O35347 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dgcr6O35347 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Dgcr6O35347 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dgcr6O35347 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dgcr6O35347 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dgcr6O35347 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dgcr6O35347 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Dgcr6O35347 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dgcr6O35347 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dgcr6O35347 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dgcr6O35347 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dgcr6O35347 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dgcr6O35347 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dgcr6O35347 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dgcr6O35347 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Dgcr6O35347 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dgcr6O35347 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dgcr6O35347 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms