Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms