Protein–RNA interactions for Protein: O35305

Tnfrsf11a, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf11aO35305 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf11aO35305 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms