Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Kcns1O35173 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcns1O35173 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Kcns1O35173 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcns1O35173 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms