Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms