Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Casq1O09165 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Casq1O09165 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Casq1O09165 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Casq1O09165 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Casq1O09165 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
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