Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Eftud2O08810 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms