Protein–RNA interactions for Protein: O08785

Clock, Circadian locomoter output cycles protein kaput, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClockO08785 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClockO08785 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClockO08785 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClockO08785 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClockO08785 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClockO08785 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClockO08785 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClockO08785 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ClockO08785 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClockO08785 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClockO08785 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClockO08785 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClockO08785 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClockO08785 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClockO08785 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClockO08785 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClockO08785 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClockO08785 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClockO08785 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClockO08785 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClockO08785 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClockO08785 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClockO08785 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClockO08785 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClockO08785 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClockO08785 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClockO08785 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClockO08785 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClockO08785 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClockO08785 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClockO08785 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClockO08785 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClockO08785 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClockO08785 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClockO08785 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClockO08785 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClockO08785 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClockO08785 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClockO08785 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClockO08785 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClockO08785 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClockO08785 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClockO08785 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClockO08785 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClockO08785 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClockO08785 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClockO08785 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClockO08785 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClockO08785 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClockO08785 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClockO08785 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ClockO08785 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClockO08785 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClockO08785 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClockO08785 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClockO08785 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClockO08785 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClockO08785 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClockO08785 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClockO08785 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClockO08785 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClockO08785 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClockO08785 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClockO08785 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClockO08785 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClockO08785 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClockO08785 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClockO08785 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClockO08785 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClockO08785 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClockO08785 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClockO08785 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClockO08785 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClockO08785 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClockO08785 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClockO08785 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ClockO08785 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClockO08785 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClockO08785 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClockO08785 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClockO08785 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClockO08785 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClockO08785 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClockO08785 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClockO08785 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClockO08785 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClockO08785 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClockO08785 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClockO08785 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClockO08785 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClockO08785 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClockO08785 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClockO08785 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClockO08785 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClockO08785 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClockO08785 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClockO08785 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClockO08785 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClockO08785 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClockO08785 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms