Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sec22bO08547 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms