Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Efna5O08543 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efna5O08543 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efna5O08543 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efna5O08543 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efna5O08543 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Efna5O08543 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efna5O08543 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efna5O08543 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efna5O08543 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efna5O08543 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms