Protein–RNA interactions for Protein: L7N2A2

Gm8906, Predicted gene 8906 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8906L7N2A2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8906L7N2A2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms