Protein–RNA interactions for Protein: L7N248

Gm6871, Predicted gene 6871, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6871L7N248 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6871L7N248 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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