Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms