Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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