Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm21900J3QP38 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm21900J3QP38 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm21900J3QP38 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm21900J3QP38 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm21900J3QP38 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm21900J3QP38 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm21900J3QP38 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm21900J3QP38 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm21900J3QP38 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm21900J3QP38 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm21900J3QP38 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21900J3QP38 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21900J3QP38 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21900J3QP38 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21900J3QP38 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21900J3QP38 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21900J3QP38 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21900J3QP38 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21900J3QP38 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21900J3QP38 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21900J3QP38 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21900J3QP38 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21900J3QP38 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21900J3QP38 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21900J3QP38 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21900J3QP38 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21900J3QP38 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21900J3QP38 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms