Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c3J3QJW5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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