Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm21060J3KMU4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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