Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pot1bH7BX60 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms