Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Cldn20G5E8X0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn20G5E8X0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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