Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34aG3UW52 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms