Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Crocc2F6XLV1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Crocc2F6XLV1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Crocc2F6XLV1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms