Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm8247F6VRJ8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm8247F6VRJ8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm8247F6VRJ8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm8247F6VRJ8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm8247F6VRJ8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm8247F6VRJ8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm8247F6VRJ8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm8247F6VRJ8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm8247F6VRJ8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm8247F6VRJ8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm8247F6VRJ8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm8247F6VRJ8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm8247F6VRJ8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm8247F6VRJ8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm8247F6VRJ8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm8247F6VRJ8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm8247F6VRJ8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm8247F6VRJ8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm8247F6VRJ8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm8247F6VRJ8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm8247F6VRJ8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm8247F6VRJ8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm8247F6VRJ8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm8247F6VRJ8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm8247F6VRJ8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm8247F6VRJ8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm8247F6VRJ8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm8247F6VRJ8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm8247F6VRJ8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm8247F6VRJ8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm8247F6VRJ8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8247F6VRJ8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8247F6VRJ8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8247F6VRJ8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8247F6VRJ8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8247F6VRJ8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8247F6VRJ8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8247F6VRJ8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8247F6VRJ8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8247F6VRJ8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gm8247F6VRJ8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8247F6VRJ8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8247F6VRJ8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8247F6VRJ8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8247F6VRJ8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8247F6VRJ8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gm8247F6VRJ8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8247F6VRJ8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8247F6VRJ8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gm8247F6VRJ8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8247F6VRJ8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gm8247F6VRJ8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8247F6VRJ8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8247F6VRJ8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gm8247F6VRJ8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gm8247F6VRJ8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm8247F6VRJ8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm8247F6VRJ8 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm8247F6VRJ8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm8247F6VRJ8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Gm8247F6VRJ8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8247F6VRJ8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8247F6VRJ8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8247F6VRJ8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8247F6VRJ8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8247F6VRJ8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8247F6VRJ8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8247F6VRJ8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8247F6VRJ8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8247F6VRJ8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8247F6VRJ8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8247F6VRJ8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8247F6VRJ8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8247F6VRJ8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8247F6VRJ8 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8247F6VRJ8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8247F6VRJ8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8247F6VRJ8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8247F6VRJ8 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8247F6VRJ8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8247F6VRJ8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8247F6VRJ8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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