Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms