Protein–RNA interactions for Protein: F6U3N7

Gm21977, Predicted gene 21977 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21977F6U3N7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gm21977F6U3N7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gm21977F6U3N7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gm21977F6U3N7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gm21977F6U3N7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gm21977F6U3N7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gm21977F6U3N7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gm21977F6U3N7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gm21977F6U3N7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21977F6U3N7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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