Protein–RNA interactions for Protein: F2Z461

Herc6, E3 ISG15--protein ligase Herc6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc6F2Z461 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Herc6F2Z461 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Herc6F2Z461 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms