Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
2610001J05RikF2Z3Y9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms