Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms