Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Urb2E9Q7L1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Urb2E9Q7L1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Urb2E9Q7L1 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Urb2E9Q7L1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Urb2E9Q7L1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Urb2E9Q7L1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Urb2E9Q7L1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Urb2E9Q7L1 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Urb2E9Q7L1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Urb2E9Q7L1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Urb2E9Q7L1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Urb2E9Q7L1 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Urb2E9Q7L1 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Urb2E9Q7L1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Urb2E9Q7L1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Urb2E9Q7L1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Urb2E9Q7L1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Urb2E9Q7L1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Urb2E9Q7L1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Urb2E9Q7L1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Urb2E9Q7L1 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Urb2E9Q7L1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Urb2E9Q7L1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Urb2E9Q7L1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Urb2E9Q7L1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Urb2E9Q7L1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Urb2E9Q7L1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Urb2E9Q7L1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Urb2E9Q7L1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Urb2E9Q7L1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Urb2E9Q7L1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Urb2E9Q7L1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Urb2E9Q7L1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Urb2E9Q7L1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Urb2E9Q7L1 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Urb2E9Q7L1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Urb2E9Q7L1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Urb2E9Q7L1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Urb2E9Q7L1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Urb2E9Q7L1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Urb2E9Q7L1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Urb2E9Q7L1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Urb2E9Q7L1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Urb2E9Q7L1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Urb2E9Q7L1 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Urb2E9Q7L1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Urb2E9Q7L1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Urb2E9Q7L1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Urb2E9Q7L1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Urb2E9Q7L1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Urb2E9Q7L1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Urb2E9Q7L1 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Urb2E9Q7L1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Urb2E9Q7L1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Urb2E9Q7L1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms