Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4Y3

4930546C10Rik, RIKEN cDNA 4930546C10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930546C10RikE9Q4Y3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930546C10RikE9Q4Y3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms