Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms