Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r238E9Q373 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r238E9Q373 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r238E9Q373 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r238E9Q373 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r238E9Q373 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r238E9Q373 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r238E9Q373 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r238E9Q373 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r238E9Q373 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r238E9Q373 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r238E9Q373 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r238E9Q373 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r238E9Q373 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r238E9Q373 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r238E9Q373 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r238E9Q373 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r238E9Q373 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r238E9Q373 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r238E9Q373 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r238E9Q373 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r238E9Q373 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r238E9Q373 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r238E9Q373 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r238E9Q373 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r238E9Q373 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r238E9Q373 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r238E9Q373 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r238E9Q373 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r238E9Q373 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r238E9Q373 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r238E9Q373 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r238E9Q373 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r238E9Q373 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r238E9Q373 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r238E9Q373 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r238E9Q373 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r238E9Q373 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r238E9Q373 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r238E9Q373 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r238E9Q373 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r238E9Q373 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r238E9Q373 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Vmn1r238E9Q373 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r238E9Q373 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms