Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tarbp1E9Q368 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms